MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Riemerella anatipestifer RA-GD chromosome

Total Repeats: 48387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017569	TTA	2	6	3	8	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017569	TGT	2	6	51	56	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017569	TTG	3	9	57	65	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017569	TAAAAA	2	12	66	77	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017569	A	7	7	73	79	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017569	A	6	6	107	112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017569	T	7	7	123	129	0 %	100 %	0 %	0 %	386320387
8	NC_017569	GTT	2	6	503	508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386320387
9	NC_017569	TTCCTC	2	12	515	526	0 %	50 %	0 %	50 %	386320387
10	NC_017569	A	6	6	597	602	100 %	0 %	0 %	0 %	386320387
11	NC_017569	TTG	2	6	618	623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386320387
12	NC_017569	CCG	2	6	695	700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386320387
13	NC_017569	ATT	2	6	736	741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320387
14	NC_017569	T	8	8	740	747	0 %	100 %	0 %	0 %	386320387
15	NC_017569	CAA	2	6	789	794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320387
16	NC_017569	TATT	2	8	822	829	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017569	AAAG	2	8	842	849	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017569	TCT	2	6	877	882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017569	ATT	2	6	895	900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320388
20	NC_017569	AAT	2	6	906	911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320388
21	NC_017569	ATT	2	6	956	961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320388
22	NC_017569	AACCTA	2	12	985	996	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386320388
23	NC_017569	TTTA	2	8	1013	1020	25 %	75 %	0 %	0 %	386320388
24	NC_017569	CCA	2	6	1032	1037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320388
25	NC_017569	C	6	6	1045	1050	0 %	0 %	0 %	100 %	386320388
26	NC_017569	ATT	2	6	1079	1084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320388
27	NC_017569	ATA	2	6	1157	1162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320388
28	NC_017569	AG	3	6	1179	1184	50 %	0 %	50 %	0 %	386320388
29	NC_017569	AAG	2	6	1221	1226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320388
30	NC_017569	CAT	3	9	1306	1314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320388
31	NC_017569	CAT	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320388
32	NC_017569	CATT	2	8	1408	1415	25 %	50 %	0 %	25 %	386320388
33	NC_017569	CTA	2	6	1438	1443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320388
34	NC_017569	T	6	6	1451	1456	0 %	100 %	0 %	0 %	386320388
35	NC_017569	TTTTAA	2	12	1462	1473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017569	TAA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017569	A	6	6	1511	1516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017569	TCT	2	6	1585	1590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320389
39	NC_017569	ATC	2	6	1611	1616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320389
40	NC_017569	CTT	2	6	1640	1645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320389
41	NC_017569	TAT	2	6	1673	1678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320389
42	NC_017569	CCA	2	6	1745	1750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386320389
43	NC_017569	TCA	2	6	1808	1813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320389
44	NC_017569	AAT	2	6	1920	1925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320389
45	NC_017569	CT	4	8	1936	1943	0 %	50 %	0 %	50 %	386320389
46	NC_017569	AT	3	6	1980	1985	50 %	50 %	0 %	0 %	386320389
47	NC_017569	GTC	2	6	2025	2030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320389
48	NC_017569	ATC	2	6	2043	2048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320389
49	NC_017569	T	6	6	2155	2160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017569	A	7	7	2162	2168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017569	A	6	6	2179	2184	100 %	0 %	0 %	0 %	386320390
52	NC_017569	T	7	7	2235	2241	0 %	100 %	0 %	0 %	386320390
53	NC_017569	A	6	6	2266	2271	100 %	0 %	0 %	0 %	386320390
54	NC_017569	T	6	6	2374	2379	0 %	100 %	0 %	0 %	386320390
55	NC_017569	T	6	6	2385	2390	0 %	100 %	0 %	0 %	386320390
56	NC_017569	TTA	2	6	2407	2412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320390
57	NC_017569	AAT	2	6	2413	2418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320390
58	NC_017569	ATA	2	6	2429	2434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320390
59	NC_017569	AAG	2	6	2436	2441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320390
60	NC_017569	AGC	2	6	2556	2561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386320390
61	NC_017569	TAGC	2	8	2601	2608	25 %	25 %	25 %	25 %	386320390
62	NC_017569	CTG	2	6	2669	2674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386320390
63	NC_017569	AAAAC	2	10	2683	2692	80 %	0 %	0 %	20 %	386320390
64	NC_017569	CAT	3	9	2738	2746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320390
65	NC_017569	TG	3	6	2766	2771	0 %	50 %	50 %	0 %	386320390
66	NC_017569	CCT	2	6	2860	2865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386320390
67	NC_017569	ATT	2	6	2947	2952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320391
68	NC_017569	CAT	2	6	3034	3039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320391
69	NC_017569	T	6	6	3056	3061	0 %	100 %	0 %	0 %	386320391
70	NC_017569	GATT	2	8	3109	3116	25 %	50 %	25 %	0 %	386320391
71	NC_017569	TA	3	6	3122	3127	50 %	50 %	0 %	0 %	386320391
72	NC_017569	GTT	2	6	3130	3135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386320391
73	NC_017569	TAAA	2	8	3150	3157	75 %	25 %	0 %	0 %	386320391
74	NC_017569	TGA	2	6	3162	3167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320391
75	NC_017569	TTA	2	6	3243	3248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320391
76	NC_017569	T	6	6	3267	3272	0 %	100 %	0 %	0 %	386320391
77	NC_017569	CAT	2	6	3301	3306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320391
78	NC_017569	ATAA	2	8	3380	3387	75 %	25 %	0 %	0 %	386320391
79	NC_017569	AAGT	2	8	3406	3413	50 %	25 %	25 %	0 %	386320391
80	NC_017569	ATAG	2	8	3659	3666	50 %	25 %	25 %	0 %	386320391
81	NC_017569	TAA	2	6	3703	3708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320391
82	NC_017569	TTC	2	6	3860	3865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320391
83	NC_017569	TCTTTA	2	12	3903	3914	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386320391
84	NC_017569	AAT	2	6	3953	3958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320391
85	NC_017569	T	8	8	3960	3967	0 %	100 %	0 %	0 %	386320391
86	NC_017569	AAG	2	6	4054	4059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320392
87	NC_017569	CGTC	2	8	4065	4072	0 %	25 %	25 %	50 %	386320392
88	NC_017569	TAG	2	6	4134	4139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320392
89	NC_017569	TAA	2	6	4182	4187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320392
90	NC_017569	AAT	2	6	4269	4274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320392
91	NC_017569	CAT	2	6	4291	4296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320392
92	NC_017569	TAA	2	6	4331	4336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320392
93	NC_017569	TTC	2	6	4354	4359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320392
94	NC_017569	TTC	2	6	4361	4366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320392
95	NC_017569	AAG	2	6	4432	4437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320392
96	NC_017569	CCTT	2	8	4454	4461	0 %	50 %	0 %	50 %	386320392
97	NC_017569	AGTTTA	2	12	4469	4480	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386320392
98	NC_017569	T	6	6	4664	4669	0 %	100 %	0 %	0 %	386320392
99	NC_017569	T	6	6	4681	4686	0 %	100 %	0 %	0 %	386320392
100	NC_017569	ATT	2	6	4726	4731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320392
101	NC_017569	CTGT	2	8	4804	4811	0 %	50 %	25 %	25 %	386320392
102	NC_017569	CAT	2	6	4816	4821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320392
103	NC_017569	AGT	2	6	4858	4863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320392
104	NC_017569	TCT	2	6	4904	4909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320392
105	NC_017569	TA	3	6	4948	4953	50 %	50 %	0 %	0 %	386320392
106	NC_017569	A	7	7	4972	4978	100 %	0 %	0 %	0 %	386320392
107	NC_017569	ATT	2	6	5018	5023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320392
108	NC_017569	AAGA	2	8	5090	5097	75 %	0 %	25 %	0 %	386320393
109	NC_017569	T	6	6	5108	5113	0 %	100 %	0 %	0 %	386320393
110	NC_017569	TGGT	2	8	5138	5145	0 %	50 %	50 %	0 %	386320393
111	NC_017569	GAA	2	6	5156	5161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320393
112	NC_017569	ACA	2	6	5170	5175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320393
113	NC_017569	ATT	2	6	5184	5189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320393
114	NC_017569	ATC	2	6	5208	5213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320393
115	NC_017569	AAC	2	6	5254	5259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386320393
116	NC_017569	ATT	2	6	5396	5401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320393
117	NC_017569	AG	4	8	5463	5470	50 %	0 %	50 %	0 %	386320393
118	NC_017569	AGT	2	6	5486	5491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017569	TAT	3	9	5602	5610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320394
120	NC_017569	TTTAAT	2	12	5620	5631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320394
121	NC_017569	TTCT	2	8	5646	5653	0 %	75 %	0 %	25 %	386320394
122	NC_017569	TCT	2	6	5726	5731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320394
123	NC_017569	TAT	2	6	5803	5808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320394
124	NC_017569	TC	3	6	5877	5882	0 %	50 %	0 %	50 %	386320394
125	NC_017569	T	6	6	5891	5896	0 %	100 %	0 %	0 %	386320394
126	NC_017569	GTTG	2	8	5901	5908	0 %	50 %	50 %	0 %	386320394
127	NC_017569	GTG	2	6	5952	5957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386320394
128	NC_017569	AT	3	6	5972	5977	50 %	50 %	0 %	0 %	386320394
129	NC_017569	TTA	2	6	6024	6029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320394
130	NC_017569	TTA	2	6	6078	6083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320394
131	NC_017569	TTC	2	6	6178	6183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386320394
132	NC_017569	AGA	2	6	6232	6237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386320394
133	NC_017569	TAA	2	6	6244	6249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320394
134	NC_017569	TAT	2	6	6250	6255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386320394
135	NC_017569	CTA	2	6	6279	6284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320394
136	NC_017569	ATA	2	6	6306	6311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386320394
137	NC_017569	ATG	3	9	6438	6446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386320394
138	NC_017569	A	7	7	6520	6526	100 %	0 %	0 %	0 %	386320394
139	NC_017569	ACT	2	6	6583	6588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386320394
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